germanyuksettings
Alle Weitere Themen Schulungen

Schulung UniProt: Analyse und Optimierung von Proteinsequenzdaten

Praxisorientierte Übungen zur Proteinsequenzanalyse

3 Tage / S4423
Neues Seminar

Schulungsformen

Inhouse-/Firmenschulung

  • 3 Tage - anpassbar
  • Termin nach Wunsch
  • Preis nach Angebot
  • In Ihrem Hause oder bei der GFU

Individualschulung

  • 3 Tage - anpassbar
  • Termin nach Wunsch
  • Preis nach Angebot
  • In Ihrem Hause oder bei der GFU

Beschreibung

UniProt ist eine unverzichtbare Ressource für die biomedizinische und biotechnologische Forschung, die umfassende und detaillierte Proteininformationen bereitstellt. Mit seinen qualitativ hochwertigen, manuell kuratierten Daten, umfangreichen funktionalen Annotationen und regelmäßigen Updates unterstützt UniProt Forscher bei der Untersuchung und Analyse von Proteinen.
In diesem Seminar lernen die Teilnehmenden die grundlegenden und fortgeschrittenen Techniken zur Nutzung von UniProt für die Proteinsequenz- und Funktionsanalyse kennen. Der Fokus liegt auf der Erstellung, Optimierung und Analyse von Proteinsequenzdaten sowie der Integration moderner Technologien, einschließlich Scripting und Automatisierung. Die Teilnehmer werden sich mit den grundlegenden und erweiterten Tools von UniProt vertraut machen und durch praxisorientierte Übungen die erlernten Konzepte anwenden.

Schulungsziel

Am Ende des Seminars sind die Teilnehmenden in der Lage, UniProt effektiv zu nutzen, um Proteinsequenzen zu analysieren, zu optimieren und zu verwalten. Sie lernen, wie sie die Effizienz und Qualität ihrer Datenabfragen und Analysen verbessern können.

Details

Wer teilnehmen sollte

Dieses Seminar richtet sich an Bioinformatiker, Molekularbiologen, Biochemiker und technische Fachkräfte, die ihre Kenntnisse mittels Einsatz von UniProt für die Proteinsequenzanalyse vertiefen und optimieren möchten. Grundlegende Kenntnisse in Bioinformatik und molekularer Biologie sind erforderlich.

Ihre Schulung


Präsenz-Schulung

Online-Schulung
Lernmethode

Ausgewogene Mischung aus Theorie und Praxis

Wie auch bei unseren Präsenz-Seminaren: Ausgewogene Mischung aus Theorie und praktischen Übungen. Trainer durchgehend präsent.

Unterlagen

Seminarunterlagen oder Fachbuch inklusive. Das Fachbuch wählt der Trainer passend zum Seminar aus - Ihren individuellen Buch-Wunsch berücksichtigen wir auf Nachfrage gerne.

Seminarunterlagen oder Fachbuch inklusive (per Post). Das Fachbuch wählt der Trainer passend zum Seminar aus - Ihren individuellen Buch-Wunsch berücksichtigen wir auf Nachfrage gerne.

Arbeitsplatz
  • PC/VMs für alle Teilnehmenden
  • Hochwertige und performante Hardware
  • Große, höhenverstellbare Bildschirme
  • Zugang zu Ihrem Firmennetz erlaubt
  • 86-90 Zoll Bildschirm für perfekte Präsentationen in jedem Schulungsraum
  • Online Meeting + Remote Zugriff auf persönlichen GFU-Schulungs-PC
  • Keine Installation auf dem eigenem PC notwendig
Lernumgebung

Neu aufgesetzte Remote-Systeme für jeden Kurs in Abstimmung mit dem Seminarleiter, sodass Sie über ein perfektes Setup für die Durchführung aller praktischen Übungen verfügen.

Arbeitsmaterialien

Din A4 Block, Notizblock, Kugelschreiber, USB-Stick, Textmarker, Post-its

Teilnahmezertifikat

Die Teilnahmezertifikat inkl. Inhaltsverzeichnis wird Ihnen am Ende des Seminars ausgehändigt.

Die Teilnahmezertifikat inkl. Inhaltsverzeichnis wird Ihnen per Post zugesandt.


Präsenz-Schulung

Online-Schulung
Teilnehmendenzahl

min. 1, max. 8 Personen

Garantierte Durchführung *

Ab 1 Teilnehmenden

Schulungszeiten
3 Tage, 09:00 - 16:00 Uhr
Ort der Schulung
GFU Schulungszentrum oder Virtual Classroom
GFU Schulungszentrum
Am Grauen Stein 27
51105 Köln-Deutz

oder online im Virtual Classroom oder europaweit bei Ihnen als Inhouse-Schulung

Um ein optimales Raumklima zu gewährleisten, haben wir das Schulungszentrum mit 17 hochmodernen Trotec TAC V+ Luftreinigern ausgestattet. Diese innovative Filtertechnologie (H14 zertifiziert nach DIN EN1822) sorgt dafür, dass die Raumluft mehrfach pro Stunde umgewälzt wird und Schadstoffe zu 99.995% im HEPA-Filter abgeschieden und infektiöse Aerosole abgetötet werden.

Zusätzlich sind alle Räume mit CO2-Ampeln ausgestattet, um jederzeit eine hervorragende Luftqualität sicherzustellen.

Räumlichkeiten

Helle und modern ausgestattete Räume mit perfekter Infrastruktur

Bequem aus dem Homeoffice von überall

All-Inclusive

Frühstück, Snacks und Getränke ganztägig, Mittagessen im eigenen Restaurant, täglich 6 Menüs, auch vegetarisch

Eine Auswahl unserer Frühstücks-Snacks und Nervennahrungs-Highlights senden wir Ihnen mit den Seminarunterlagen per Post zu.
Barrierefreiheit

Das GFU-Schulungszentrum (Am Grauen Stein 27) ist barrierefrei

-

Präsenz-Schulung

Online-Schulung
  • Eigener Shuttle-Service
  • Reservierte Parkplätze
  • Hotelreservierung
  • Technik-Sofort-Support

Inhalt

  • Einführung in UniProt: Überblick und Bedeutung
    • Was ist UniProt und warum ist es wichtig?
      • Definition und Hintergrund: UniProt als umfassende Proteinsequenz- und Funktionsdatenbank.
      • Bedeutung und Vorteile: Unterstützung der biowissenschaftlichen Forschung, umfassende Datensätze, hohe Qualität und Genauigkeit.
      • Vergleich mit ähnlichen Tools: Unterschiede und Vorteile gegenüber GenBank, PDB und Pfam.
  • Grundlagen der UniProt-Website und -Datenbanken
    • Navigieren auf der UniProt-Website
      • Einführung in die Benutzeroberfläche: Navigationsmenü, Suchfunktionen, Datenzugriff.
      • Erstellen und Verwalten von Abfragen: Basis- und erweiterte Suchoptionen.
      • Überblick über die UniProt-Datenbanken: UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL, UniRef, UniParc.
  • Grundlegende Funktionen und Bedienung
    • Datenabfrage und -visualisierung
      • Importieren und Exportieren von Daten: Formate, Tools und Methoden.
      • Visualisierung von Proteinsequenzen und -strukturen: Tools und Techniken.
      • Nutzung von Annotationen und Metadaten: Interpretieren und Anwenden von Daten.
  • Erste Schritte mit UniProt
    • Einfache Datenabfragen und Analysen
      • Durchführung von Sequenzsuchen: BLAST, HMMER.
      • Analyse von Proteinsequenzen: Homologie, Domänen, Motive.
      • Nutzung von UniProt-Tools: ProtParam, ProtScale, Align.
  • Praxisübung 1: Abfrage und Analyse von Proteinsequenzen
    • Ziel der Übung: Anwendung der erlernten Techniken zur Abfrage und Analyse von Proteinsequenzen.
      • Projektbeschreibung: Teilnehmer erstellen Abfragen und analysieren eine Proteinsequenz mithilfe von UniProt-Tools.
      • Anforderungen: Nutzung der grundlegenden Funktionen und Tools von UniProt.
    • Schritt-für-Schritt-Anleitung:
      • Vorbereitung: Einführung in die Projektanforderungen, Einrichtung der Umgebung.
      • Durchführung: Erstellung von Abfragen, Analyse der Proteinsequenzen, Nutzung der Tools.
      • Präsentation: Vorstellung der Ergebnisse durch die Teilnehmer.
    • Tools: UniProt-Website, ProtParam, BLAST.
    • Ergebnisse und Präsentation:
      • Präsentation der durchgeführten Abfragen und Analysen.
      • Diskussion und Feedback: Analyse der Ergebnisse und Verbesserungsvorschläge.
  • Vertiefte Analyse und Datenintegration
    • Erweiterte Such- und Analysetechniken
      • Nutzung von erweiterten Suchparametern: Filtern und Verfeinern von Suchergebnissen.
      • Integration von externen Datenquellen: Verknüpfung von UniProt-Daten mit anderen Datenbanken (z.B. PDB, KEGG).
      • Analyse komplexer Datensätze: Multidimensionale Analysen, Netzwerkanalysen.
  • Integration und Datenmanagement
    • Integration mit bioinformatischen Tools und Pipelines
      • Anbindung an Analyse-Tools: Nutzung von Jupyter Notebooks, R und Python für Datenanalysen.
      • Datenmanagement und -synchronisierung: Verwaltung von Datenflüssen und -integrität.
      • Datenschutz und Compliance: Einhaltung von Datenschutzbestimmungen und Sicherheitsstandards.
  • Scripting und Automatisierung
    • Automatisierung von Abfragen und Analysen
      • Einführung in die UniProt REST API: Grundlagen und Nutzung.
      • Erstellung von Skripten zur Automatisierung: Python, R.
      • Erweiterte Scripting-Techniken: Batch-Verarbeitung, Schleifen, Bedingungen.
  • Analyse und Optimierung von Datenabfragen
    • Überwachung und Fehlersuche
      • Überwachung und Analyse der Abfragequalität: Nutzung von Dashboards und Berichten.
      • Protokollierung und Fehlersuche: Methoden zur Fehleranalyse und -behebung.
      • Optimierung von Abfragen: Durchführung von Tests, Analyse der Ergebnisse, kontinuierliche Verbesserung.
  • Praxisübung 2: Erstellung und Automatisierung komplexer Datenabfragen
    • Ziel der Übung: Anwendung der erlernten Techniken zur Erstellung und Automatisierung komplexer Datenabfragen.
      • Projektbeschreibung: Teilnehmer erstellen und automatisieren komplexe Abfragen mithilfe der UniProt REST API.
      • Anforderungen: Nutzung der erweiterten Funktionen und Scripting-Tools von UniProt.
    • Schritt-für-Schritt-Anleitung:
      • Vorbereitung: Einführung in die Projektanforderungen, Einrichtung der Umgebung.
      • Durchführung: Erstellung der Abfragen, Integration von Skripten, Analyse der Ergebnisse.
      • Präsentation: Vorstellung der Ergebnisse durch die Teilnehmer.
    • Tools: UniProt REST API, Python, Jupyter Notebook.
    • Ergebnisse und Präsentation:
      • Präsentation der erstellten Abfragen und der durchgeführten Automatisierungen.
      • Diskussion und Feedback: Analyse der Ergebnisse und Verbesserungsvorschläge.

Buchungsmöglichkeiten

Online oder in Präsenz teilnehmen

Sie können sowohl Online als auch in Präsenz am Seminar teilnehmen. Klicken Sie bei Ihrer Buchung oder Anfrage einfach die entsprechende Option an.

Inhouse-/Firmenschulung

Inhalte werden auf Wunsch an die Anforderungen Ihres Teams angepasst.

Individualschulung

Fokus aufs Fachliche und maximaler Raum für individuelle Fragen.

So haben GFU-Kunden gestimmt

Zu diesem Seminar wurden noch keine Bewertungen abgegeben.

FAQ für Inhouse Schulungen

Bei einer offenen Schulung stehen Ort und Termin vorab fest. Jeder Interessent kann eine offene Schulung buchen, daher treffen Teilnehmer aus verschiedenen Unternehmen aufeinander.

Inhouse Schulungen können auf Ihren individuellen Schulungsbedarf zugeschnitten werden. Sie bestimmen den Teilnehmerkreis, Termin und Schulungsort.

Bei einer Inhouse Schulung gehen wir auf die individuellen Bedürfnisse Ihres Unternehmens ein und decken den Schulungsbedarf direkt bei Ihnen im Unternehmen ab.

Das spart Zeit und Geld und sorgt für einen schnellen Wissenstransfer Ihrer Mitarbeiter.

Eine komplette Lernumgebung in der Cloud mit Remote Zugriff ist für uns selbstverständlich. Sie müssen sich um nichts kümmern. Lediglich ein funktionierender PC oder Notebook mit Internetanschluss sollte für jeden Teilnehmer am Schulungstag bereit stehen.

  • Kompetente Seminarberatung
  • Dozenten aus der Praxis
  • Auf Ihre Bedürfnisse zugeschnittener individueller Lernstoff
  • Sie können den Termin flexibel gestalten, so wie es für Sie am besten passt
  • Unsere Inhouse Schulungen können Europaweit durchgeführt werden
  • Der Fokus liegt auf Ihrem Schulungsbedarf, somit schonen Sie Ihr Budget
  • Wissenslücken Ihrer Mitarbeitet werden schnell geschlossen
132.708
TEILNEHMENDE
2.846
SEMINARTHEMEN
32.774
DURCHGEFÜHRTE SEMINARE
aegallianzaxabayerElement 1boschdeutsche-bankdeutsche-postdouglasfordfujitsuhenkelhermeslufthansamercedesnokiasonytelekomvwzdf