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Schulung Einführung in die MATLAB Bioinformatics Toolbox

Praxisorientierte Übungen zur Bioinformatik

3 Tage / S4455

Schulungsformen

Inhouse-/Firmenschulung

  • 3 Tage - anpassbar
  • Termin nach Wunsch
  • Preis nach Angebot
  • In Ihrem Hause oder bei der GFU

Individualschulung

  • 3 Tage - anpassbar
  • Termin nach Wunsch
  • Preis nach Angebot
  • In Ihrem Hause oder bei der GFU

Beschreibung

In diesem Seminar lernen die Teilnehmenden die grundlegenden und fortgeschrittenen Techniken zur Nutzung der Bioinformatics Toolbox für die Analyse und Visualisierung von biologischen Daten kennen. Der Fokus liegt auf der Erstellung, Optimierung und Automatisierung von bioinformatischen Analysen sowie der Integration moderner Technologien. Die Teilnehmer werden sich mit den grundlegenden und erweiterten Tools der Bioinformatics Toolbox vertraut machen und durch praxisorientierte Übungen die erlernten Konzepte anwenden.

Schulungsziel

Am Ende des Seminars sind die Teilnehmenden in der Lage, die Bioinformatics Toolbox effektiv zu nutzen, um bioinformatische Analysen durchzuführen, Daten zu visualisieren und die Leistung ihrer bioinformatischen Projekte zu optimieren. Sie lernen, wie sie die Effizienz und Qualität ihrer Analysen verbessern können.

Details

Wer teilnehmen sollte

Dieses Seminar richtet sich an Bioinformatiker, Biologen, Datenanalysten und technische Fachkräfte, die ihre Kenntnisse im Einsatz der Bioinformatics Toolbox für die Analyse und Visualisierung von biologischen Daten vertiefen und optimieren möchten. Grundlegende IT- und Programmierkenntnisse sind erforderlich.

Ihre Schulung


Präsenz-Schulung

Online-Schulung
Lernmethode

Ausgewogene Mischung aus Theorie und Praxis

Wie auch bei unseren Präsenz-Seminaren: Ausgewogene Mischung aus Theorie und praktischen Übungen. Trainer durchgehend präsent.

Unterlagen

Seminarunterlagen oder Fachbuch inklusive. Das Fachbuch wählt der Trainer passend zum Seminar aus - Ihren individuellen Buch-Wunsch berücksichtigen wir auf Nachfrage gerne.

Seminarunterlagen oder Fachbuch inklusive (per Post). Das Fachbuch wählt der Trainer passend zum Seminar aus - Ihren individuellen Buch-Wunsch berücksichtigen wir auf Nachfrage gerne.

Arbeitsplatz
  • PC/VMs für alle Teilnehmenden
  • Hochwertige und performante Hardware
  • Große, höhenverstellbare Bildschirme
  • Zugang zu Ihrem Firmennetz erlaubt
  • 86-90 Zoll Bildschirm für perfekte Präsentationen in jedem Schulungsraum
  • Online Meeting + Remote Zugriff auf persönlichen GFU-Schulungs-PC
  • Keine Installation auf dem eigenem PC notwendig
Lernumgebung

Neu aufgesetzte Remote-Systeme für jeden Kurs in Abstimmung mit dem Seminarleiter, sodass Sie über ein perfektes Setup für die Durchführung aller praktischen Übungen verfügen.

Arbeitsmaterialien

Din A4 Block, Notizblock, Kugelschreiber, USB-Stick, Textmarker, Post-its

Teilnahmezertifikat

Die Teilnahmezertifikat inkl. Inhaltsverzeichnis wird Ihnen am Ende des Seminars ausgehändigt.

Die Teilnahmezertifikat inkl. Inhaltsverzeichnis wird Ihnen per Post zugesandt.


Präsenz-Schulung

Online-Schulung
Teilnehmendenzahl

min. 1, max. 8 Personen

Garantierte Durchführung *

Ab 1 Teilnehmenden

Schulungszeiten
3 Tage, 09:00 - 16:00 Uhr
Ort der Schulung
GFU Schulungszentrum oder Virtual Classroom
GFU Schulungszentrum
Am Grauen Stein 27
51105 Köln-Deutz

oder online im Virtual Classroom oder europaweit bei Ihnen als Inhouse-Schulung

Um ein optimales Raumklima zu gewährleisten, haben wir das Schulungszentrum mit 17 hochmodernen Trotec TAC V+ Luftreinigern ausgestattet. Diese innovative Filtertechnologie (H14 zertifiziert nach DIN EN1822) sorgt dafür, dass die Raumluft mehrfach pro Stunde umgewälzt wird und Schadstoffe zu 99.995% im HEPA-Filter abgeschieden und infektiöse Aerosole abgetötet werden.

Zusätzlich sind alle Räume mit CO2-Ampeln ausgestattet, um jederzeit eine hervorragende Luftqualität sicherzustellen.

Räumlichkeiten

Helle und modern ausgestattete Räume mit perfekter Infrastruktur

Bequem aus dem Homeoffice von überall

All-Inclusive

Frühstück, Snacks und Getränke ganztägig, Mittagessen im eigenen Restaurant, täglich 6 Menüs, auch vegetarisch

Eine Auswahl unserer Frühstücks-Snacks und Nervennahrungs-Highlights senden wir Ihnen mit den Seminarunterlagen per Post zu.
Barrierefreiheit

Das GFU-Schulungszentrum (Am Grauen Stein 27) ist barrierefrei

-

Präsenz-Schulung

Online-Schulung
  • Eigener Shuttle-Service
  • Reservierte Parkplätze
  • Hotelreservierung
  • Technik-Sofort-Support

Inhalt

  • Einführung in die Bioinformatics Toolbox: Überblick und Bedeutung
    • Was ist die Bioinformatics Toolbox und warum ist sie wichtig?
      • Definition und Hintergrund: Toolbox zur Analyse und Visualisierung von biologischen Daten.
      • Bedeutung und Vorteile: Unterstützung bei der Sequenzanalyse, Genomik, Proteomik und weiteren Bereichen der Bioinformatik.
      • Vergleich mit ähnlichen Tools: Unterschiede und Vorteile gegenüber Bioconductor, Galaxy und anderen bioinformatischen Tools.
  • Grundlagen der Bioinformatics Toolbox-Installation und -Einrichtung
    • Installation und Konfiguration
      • Systemanforderungen und unterstützte Plattformen: Hardware- und Softwarevoraussetzungen.
      • Installation der Bioinformatics Toolbox: Schritt-für-Schritt-Anleitung.
      • Erste Konfiguration: Einrichtung der Benutzeroberfläche, grundlegende Einstellungen und Optimierungen.
  • Grundlegende Bedienung und Funktionen
    • Basis-Funktionen und Benutzeroberfläche
      • Einführung in die MATLAB-Benutzeroberfläche: Navigationsmenü, Arbeitsbereich, Editor.
      • Grundlegende Konzepte der Bioinformatik: Sequenzanalyse, Alignment, Datenbankabfragen.
      • Verwendung der Bioinformatics Toolbox: Erstellen und Verwalten von bioinformatischen Projekten und Analysen.
  • Erste Schritte mit der Bioinformatics Toolbox
    • Einfache bioinformatische Analysen
      • Sequenzanalyse: DNA-, RNA- und Proteinsequenzen.
      • Alignment von Sequenzen: Paarweises Alignment, multiple Sequenzalignments.
      • Datenbankabfragen: Zugriff auf NCBI-Datenbanken, GenBank, PDB.
  • Praxisübung 1: Einrichtung und Grundkonfiguration der Bioinformatics Toolbox
    • Ziel der Übung: Anwendung der erlernten Techniken zur Einrichtung und Grundkonfiguration der Bioinformatics Toolbox.
      • Projektbeschreibung: Teilnehmer installieren die Toolbox und erstellen erste einfache bioinformatische Analysen.
      • Anforderungen: Nutzung der grundlegenden Funktionen und Befehle der Bioinformatics Toolbox.
    • Schritt-für-Schritt-Anleitung:
      • Vorbereitung: Einführung in die Projektanforderungen, Einrichtung der Umgebung.
      • Durchführung: Installation der Bioinformatics Toolbox, Durchführung einfacher Analysen.
      • Präsentation: Vorstellung der Ergebnisse durch die Teilnehmer.
    • Tools: MATLAB, Bioinformatics Toolbox, Webbrowser, Texteditor oder integrierte Entwicklungsumgebung (IDE).
    • Ergebnisse und Präsentation:
      • Präsentation der eingerichteten Umgebung und der ersten Analysen.
      • Diskussion und Feedback: Analyse der Ergebnisse und Verbesserungsvorschläge.
  • Erweiterte bioinformatische Analysen und Modellierung
    • Erweiterte Konfiguration und Anpassung
      • Nutzung komplexer bioinformatischer Methoden: Genexpressionsanalyse, SNP-Analyse.
      • Erstellen benutzerdefinierter Algorithmen: Erweiterung der Analyse- und Modellierungsmöglichkeiten.
      • Optimierung und Fehlerbehebung: Debugging und Performance-Optimierung.
  • Integration und Datenmanagement
    • Integration mit anderen Tools und Plattformen
      • Anbindung an externe Datenquellen und -banken: Integration von Sequenz- und Strukturinformationen.
      • Datenmanagement und -synchronisierung: Verwaltung von Datenflüssen und Echtzeit-Updates.
      • Datenschutz und Compliance: Einhaltung von Datenschutzbestimmungen und Sicherheitsstandards.
  • Scripting und Automatisierung
    • Automatisierung komplexer bioinformatischer Prozesse
      • Einführung in die MATLAB-Skriptumgebung: Grundlagen und Syntax.
      • Erstellung von Skripten zur Automatisierung: Schleifen, Bedingungen, Funktionen.
      • Erweiterte Scripting-Techniken: Fehlerbehandlung, Debugging, Performance-Optimierung.
  • Analyse und Optimierung von bioinformatischen Projekten
    • Überwachung und Fehlersuche
      • Überwachung und Analyse der Systemleistung: Nutzung von Dashboards und Berichten.
      • Protokollierung und Fehlersuche: Methoden zur Fehleranalyse und -behebung.
      • Optimierung von bioinformatischen Projekten: Durchführung von Tests, Analyse der Ergebnisse, kontinuierliche Verbesserung.
  • Praxisübung 2: Erweiterte bioinformatische Analysen und Automatisierung in der Bioinformatics Toolbox
    • Ziel der Übung: Anwendung der erlernten Techniken zur erweiterten Analyse und Automatisierung in der Bioinformatics Toolbox.
      • Projektbeschreibung: Teilnehmer erstellen komplexe bioinformatische Analysen und automatisieren Prozesse.
      • Anforderungen: Nutzung der erweiterten Funktionen und Scripting-Tools der Bioinformatics Toolbox.
    • Schritt-für-Schritt-Anleitung:
      • Vorbereitung: Einführung in die Projektanforderungen, Einrichtung der Umgebung.
      • Durchführung: Erstellung und Konfiguration von erweiterten Analysen, Entwicklung von Automatisierungsskripten.
      • Präsentation: Vorstellung der Ergebnisse durch die Teilnehmer.
    • Tools: MATLAB, Bioinformatics Toolbox, Webbrowser, Texteditor oder IDE.
    • Ergebnisse und Präsentation:
      • Präsentation der erstellten Analysen und der durchgeführten Automatisierungen.
      • Diskussion und Feedback: Analyse der Ergebnisse und Verbesserungsvorschläge.

Buchungsmöglichkeiten

Online oder in Präsenz teilnehmen

Sie können sowohl Online als auch in Präsenz am Seminar teilnehmen. Klicken Sie bei Ihrer Buchung oder Anfrage einfach die entsprechende Option an.

Inhouse-/Firmenschulung

Inhalte werden auf Wunsch an die Anforderungen Ihres Teams angepasst.

Individualschulung

Fokus aufs Fachliche und maximaler Raum für individuelle Fragen.

So haben GFU-Kunden gestimmt

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FAQ für Inhouse Schulungen

Bei einer offenen Schulung stehen Ort und Termin vorab fest. Jeder Interessent kann eine offene Schulung buchen, daher treffen Teilnehmer aus verschiedenen Unternehmen aufeinander.

Inhouse Schulungen können auf Ihren individuellen Schulungsbedarf zugeschnitten werden. Sie bestimmen den Teilnehmerkreis, Termin und Schulungsort.

Bei einer Inhouse Schulung gehen wir auf die individuellen Bedürfnisse Ihres Unternehmens ein und decken den Schulungsbedarf direkt bei Ihnen im Unternehmen ab.

Das spart Zeit und Geld und sorgt für einen schnellen Wissenstransfer Ihrer Mitarbeiter.

Eine komplette Lernumgebung in der Cloud mit Remote Zugriff ist für uns selbstverständlich. Sie müssen sich um nichts kümmern. Lediglich ein funktionierender PC oder Notebook mit Internetanschluss sollte für jeden Teilnehmer am Schulungstag bereit stehen.

  • Kompetente Seminarberatung
  • Dozenten aus der Praxis
  • Auf Ihre Bedürfnisse zugeschnittener individueller Lernstoff
  • Sie können den Termin flexibel gestalten, so wie es für Sie am besten passt
  • Unsere Inhouse Schulungen können Europaweit durchgeführt werden
  • Der Fokus liegt auf Ihrem Schulungsbedarf, somit schonen Sie Ihr Budget
  • Wissenslücken Ihrer Mitarbeitet werden schnell geschlossen
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